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TaqMan探針法是針對DNA上的SNP位點設計PCR引物和TaqMan探針,進行實時熒光PCR擴增檢測的方法,通常用于少量SNP位點的分析,核酸定量分析以及腫瘤細胞突變分析等。探針的5’-端和3’-端分別標記一個熒光報告基團(Reporter,如FAM、VIC、HEX等)和一個熒光淬滅基團(Quencher,如TAMRA、BHQ1等)。當熒光探針保持完整時,5′-端報告基團經儀器光源激發的熒光正好被近距離的3′端熒光基團淬滅,儀器檢測不到5′端報告基團所激發的熒光信號。PC...
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SNaPshot基因分型技術是由美國ABI公司開發的一種基于熒光標記單堿基延伸鏈終止反應原理的分型技術,主要針對中小通量的SNP分型項目。簡單說來,在一個含有測序酶、四種熒光標記ddNTP、緊臨SNP位點5’-端的不同長度延伸引物和模板DNA的反應體系中,引物延伸一個堿基即終止,經ABI3730XL測序儀檢測后,根據峰的位置確定該延伸產物對應的SNP位點,而根據峰的顏色可得知摻入的堿基種類,從而確定該樣本的基因型。同時,通過多重PCR反應體系,可以同時檢測多種SNP位點,通常...
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質譜法基因分型技術簡介DNA質譜陣列基因分析系統以其通量高、自動化、靈活、結果準確、實驗成本低廉等諸多優勢成為了大學、醫學生物學研究所、生物技術公司、制藥企業、疾控中心等機構所推崇的研究工具。應用領域涵蓋醫學及轉化醫學、分子生物學、基因組學、表觀遺傳學、農業遺傳育種及轉基因技術等相關領域。檢測儀器信息SequenomMassArray時間飛行質譜生物芯片系統是為基因組學研究提供兼顧靈敏度和特異服務的中高通量技術平臺,廣泛地應用于遺傳突變檢測、SNP分型以及DNA甲基化定量分析...
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KASP基因分型介紹KASP(KompetitiveAllele-SpecificPCR),即競爭性等位基因特異性PCR,原理上與TaqMan檢測法類似,都是基于終端熒光信號的讀取判斷,每孔反應都是采用雙色熒光檢測一個SNP位點的兩種基因型,不同的SNP對應著不同的熒光信號。KASP技術與TaqMan法類似,它與TaqMan技術不同的是,它不需要每個SNP位點都合成特異的熒光引物,它基于*的ARMPCR原理,所有的位點檢測終都可以使用通用熒光引物進行擴增,這降低了KASP技術...
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